Էուկարիոտիկ բջջի ձևավորումը երկրորդ կարևորագույն (բուն կյանքի հայտնվելուց հետո) էվոլյուցիոն իրադարձությունն էր: Էուկարիոտների և պրոկարիոտ օրգանիզմների հիմնական և հիմնարար տարբերությունը ավելի զարգացած գենոմային համակարգի առկայությունն է։ Բջջային միջուկի տեսքի և զարգացման շնորհիվ միաբջիջ օրգանիզմների հարմարվողականության աստիճանը գոյության կանոնավոր փոփոխվող պայմաններին և արագ հարմարվելու կարողությունը՝ առանց գենային համակարգում էական ժառանգական փոփոխություններ մտցնելու, կտրուկ աճել է։
:
Էուկարիոտիկ բջիջը, որի ցիտոպլազմը ակտիվ նյութափոխանակության գործընթացների տարածք է, որը հաջողությամբ առանձնացվել է գենետիկական տեղեկատվության պահպանման, ընթերցման և կրկնօրինակման գոտուց, պարզվեց, որ ունակ է հետագա կենսաբանական էվոլյուցիայի: Այս դարաշրջանային և ճակատագրական էվոլյուցիոն իրադարձությունը, ըստ գիտնականների, տեղի է ունեցել ոչ ուշ, քան 2,6 միլիարդ տարի առաջ երկու երկրաբանական հանգրվանների՝ Արխեյան և Պրոտերոզոյան միացման վայրում:
Կենսաբանական կառուցվածքների հարմարվողականության և կայունության աճն անփոխարինելի պայման է լիարժեք կենսաբանական էվոլյուցիայի համար: Հենց հարմարվելու իր բարձր ունակության շնորհիվ էուկարիոտային բջիջը կարողացավ վերածվել բազմաբջջային օրգանիզմների, որոնք ունեն բարդ կառուցվածքային կազմակերպություն: Իրոք, բազմաբջիջ կենսաբանական համակարգերում նույն գենոմով բջիջները, հարմարվելով փոփոխվող պայմաններին, ձևավորում են հյուսվածքներ, որոնք բոլորովին տարբեր են՝ թե՛ իրենց մորֆոլոգիական հատկություններով, թե՛ ֆունկցիոնալությամբ: Սա էուկարիոտների մեծ էվոլյուցիոն հաղթանակն է, որը հանգեցրեց մոլորակի վրա կյանքի ձևերի այսպիսի մեծ բազմազանության առաջացմանը և հենց մարդու էվոլյուցիոն ասպարեզ մուտք գործելուն:
:
Էուկարիոտային տիպի բջիջների կառուցվածքն ունի մի քանի բնորոշ հատկանիշներ, որոնք բնորոշ չեն պրոկարիոտներին։ Էուկարիոտիկ բջիջը պարունակում է մեծ քանակությամբ գենետիկական նյութ (90%), որը կենտրոնացած է քրոմոսոմային կառուցվածքներում, որն ապահովում է դրանց տարբերակումն ու մասնագիտացումը։ Ցանկացած էուկարիոտ բջիջ բնութագրվում է առանձին միջուկի առկայությամբ։ Սա բջիջների այս տեսակի հիմնական տարբերակիչ առանձնահատկությունն է: Մեկ այլ կարևոր տարբերություն պրոկարիոտներից էուկարիոտիկ բջջի օրգանելներն են՝ մշտական և բազմազան ներբջջային կառուցվածքներ։
Էուկարիոտ բջիջը, համեմատած պրոկարիոտային բջիջի հետ, ունի տարբեր նյութերի ընկալման ավելի բարդ բազմաստիճան համակարգ։ Բնության մեջ չկա էուկարիոտային տիպի տիպիկ ունիվերսալ բջիջ։ Բոլոր նրանցբնութագրվում է անհավանական բազմազանությամբ, ինչը պայմանավորված է հենց էվոլյուցիոն հարմարվողականության անհրաժեշտությամբ: Էուկարիոտների շատ կարևոր հատկանիշը նրանց բնորոշ մասնատումն է` բոլոր կենսաքիմիական գործընթացների տեղայնացումը ներբջջային թաղանթով առանձնացված առանձին բջիջներում: Էուկարիոտներն ունեն մի շարք բարդ կառուցվածքային բաղադրիչներ։ Ինչպիսին է մեմբրանի համակարգը; ցիտոպլազմային մատրիցա, որը հիմնական ներբջջային նյութն է. բջջային օրգանելները էուկարիոտների հիմնական ֆունկցիոնալ բաղադրիչներն են: